Das Kinderheim war, was die Belegung betrifft, von Anfang an ein Erfolg und schien einer guten Zukunft entgegenzusehen. Diese Entwicklung wurde aber 1939 durch den Ausbruch des Zweiten Weltkrieges jäh unterbrochen.
Am 16. September 1939 mussten sowohl das Kurhaus wie auch das Kinderheim für die Armee geräumt werden.
600 Mann wurden einquartiert, einzig der Restaurationsbetrieb konnte weitergeführt werden. Der Alvier hat in den folgenden Jahren noch viel Militär gesehen, das in der Umgebung untergebracht war.

Das Kinderheim wurde erst am 5. Mai 1941 wiedereröffnet.
In diesem Jahr gab es einen Gedenktag der zum 20jährigen Einrücken von 1939 stattfand. Von diesem Treffen zeugt heute noch der Gedenkstein, oberhalb des Hotels Alvier, der damals errichtet wurde.